據南方日報報道，國家海洋局南海分局負責人透露，據國家海洋局主持的第二次全國污染基??調查資料顯示，目前，珠江口已成爲我國污染嚴重的海域之一，僅次於渤海灣。
據調查統計，1998年沿海地區企業排入近岸海域工業廢水約39.8億噸，其中廣東約佔21%，達8.35億噸，爲全國最高，而主要納污海區就在珠江口；全省沿岸地區每年接納陸源入海污水量達4406億噸，其中珠江口海區3787億噸，佔86.0%；全省沿岸海域接納污染物總量爲354.9萬噸(不包括海上石油平臺泄漏)，珠江口竟佔了93.59%。
國家海洋局多年對珠江口水質的檢測表明，珠江口已成爲生態脆弱帶和赤潮多發敏感區，這裏的魚、蟹、貝棲息繁衍場所銳減，珍稀動植物生存受到嚴重威脅。90年代珠江口每年漁獲量在40萬擔以上，目前每年只有4萬擔。
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