《中國》電子期刊的主辦人時寒冰就此發表文章:
《南方週末》2002年3月21日有2個不同的版本！原因是《南方週末》披露了有關希望工程的醜聞，最終遭到查封。伸向希望工程的黑手不僅僅毀壞了中國希望工程的聲譽，也毀壞了中國「有關部門」的信譽。我自己認爲，這種腐敗是天底下最爲可恥的惡行之一，因爲，它耽誤的是渴望求學的孩子們的前途，它玷污的是一塊最爲神聖的事業。當那些畜生把貪婪的手伸向孩子們的時候，他們已經喪失了僅有的人性和良知。而且，希望工程的資金都來自於好心人的無償贊助，正是那些錢在給孩子們帶來微弱的陽光和希望，當他們知道自己的錢並沒有給孩子們帶來福音，而是被腐敗分子吞噬的時候，他們的內心該是一種怎樣的失望和哀痛……
然而，就是這樣的禽獸不如的東西竟然也受到保護！
然而，就是這些的禽獸不如的惡行竟然也被無端掩蓋！
我實在難以理解「有關部門」的行爲。中國希望工程的黑幕曾經多次被國內外媒體披露，其聲譽早已受到損害。如果「有關部門」當機立斷，把腐敗分子繩子以法，使資金的運作更加透明和公開，不僅僅希望工程的聲譽會得到恢復，中國的聲譽也會大大提高。
「有關部門」，你爲什麼總是以婊子的標準和婊子的手段作踐自己！
「有關部門」，你現在在代表誰的利益！你是誰的部誰的門！
「有關部門」，當你與惡人狼狽爲奸的時候你的合法性何在！
《南方週末》幾經整肅，已經快死掉了。其實死掉的何止是一家報社，死掉的還有那些在極力捍衛自己最後信仰的人。當這些人被整肅以後，當這些人像其他人一樣，對光身子的皇帝高唱讚歌的時候，恐怕死掉的就不是一兩個人了，而是整整一個時代。
帶著對人類尚未完全泯滅的良知的信任，在還沒有墮落到去學唱讚歌之前，寫下了上面的話。
《南方週末》那篇被槍斃的是作者方進玉的文章--《中國青基會"辦公經費"隱瞞了什麼？》，全文如下：
2月28日的中國青基會《嚴正聲明》指出："中國青基會在實施希望工程的過程中，既不能在捐款中列支行政管理經費，也沒有得到政府的一分錢經費撥款"，但"希望工程創造了世界公益事業發展史上低成本高效率運行的奇蹟"。
然而，舉報人指出：徐永光四處哭訴"希望工程辦公經費嚴重不足"，不對。因爲徐永光隱瞞了如下重要事實：
其一，因我國匯率調整，希望工程的外幣捐款曾創造出不少"溢價收入"。希望工程接受的捐款分兩部分，一是定向捐款，例如"結對"捐贈給失學兒童或指定捐贈的希望小學；另一部分是沒有具體指向的，俗稱"一般性捐款"。第二類捐款往往被老徐列入"希望工程基金"。而"一般性捐款"之中，又有許多是海外熱心人士或海外社會團體、外資企業捐贈的外幣捐款。到1997年7月，海外捐款佔整個總捐贈的1/3強。而在1993年和1994年，據《希望工程調查報告》披露，海外捐款一度這到總捐款的1/2。
衆所周知，1994年，我國政府曾調整外匯匯率，l美元從原來兌換人民幣5元多"漲"到了8元多。匯率變化，使滯留在希望工程賬上的外幣捐款"增值"不少。國家規定，外幣捐款利息以及因匯率調整而產生的"溢價收入"，均可"用作"希望工程的"辦公經費"。這一數額較大的"收入"，同樣可以支撐希望工程的"運轉"，中國青基會無權對其忽略不計或者故意隱瞞。
問題是，青基會隱瞞過外幣捐款的"利息收入"嗎？答案，似乎是肯定的。
證據一，1993年2月25日，中國青基會與北京大興財政局簽訂了《美元與人民幣相互存款協議》，協議規定，中國青基會將美元200萬元存入大興財政局賬戶，大興財政局則將1460萬元人民幣存入青基會賬戶，存款期限爲三年，相互不"索取"利息，也不再"計較"利息差。此後幾年，大興財政局又存入青基會賬戶人民幣110萬元，美元4.8萬元。證據進一步顯示：三年存款期滿之後的1996年8月，中國青基會才發現，按照當時美元匯率8.3071計算，大興財政局仍"欠"青基會51.5萬元。徐永光立即發出指示："基金部應儘快將大興財政局欠款追回，爭取在年內把賬調整過來，以減少審計風險"。
證據二，1995年6月28日，中國青基會致函深圳新產業公司，稱：請按我會與貴公司199 5年3月31日簽署的協議書第二款規定，將我會存留在你賬戶上的10萬美元（原有50萬，現存10萬），電匯49000美元於我會指定賬戶。開戶名：北京仁美廣告有限公司。開戶行：中行北京分行國貿中心分理處。賬號：148250036068。
記者查實：此次調度外匯的原因是，中國青基會領導、省級青基會祕書長以及受助大學生，需組團赴北歐"考察"，且事先由"北京恆美"代爲墊支49000美元，匯至芬蘭航空公司作爲出國費用。因此，中國青基會需從"深圳新產業"調出同樣數額美元，歸還"北京恆美"。
證據還顯示，至1997年9月，中國青基會在深圳新產業的"存款利息"已有63萬餘元（系5 0萬美元、10萬美元和5.1萬美元分段計算的人民幣利息）。此時，青基會領導要求下屬完成的"任務"是：1．"請基金部協助催收51000美元的欠款"；2．將63萬元利息調回我會賬戶，以便"儘早將該筆賬做平"。
國家有關部門對希望工程一直予以照顧，允許青基會在中國銀行開設"現匯賬戶"。其好處是，外幣捐款到賬後，不必像一般外貿企業賺取外匯那樣被立即兌換爲人民幣存款，而是可以無限期地以外幣形式存放在銀行，並可根據需要或者匯率變化，隨時兌換。可是，青基會領導人仍嫌這一"照顧"不夠寬鬆，於是把200萬美元存入了北京大興財政局，把50萬美元"存"在了深圳新產業公司。
其二，"希望工程紀念幣"也曾給希望工程帶來"超值收入"。
1994年10月26日，爲紀念希望工程實施5週年，中國人民銀行發行了"希望工程紀念幣"，該幣面值1元，但因其發行量不大，且鄧小平手書的"希望工程"4個字和英文的"中國人民銀行"幾個字被同時鐫刻在硬幣上，因此在錢幣收藏市場上，希望工程紀念幣後來可以賣出較高價格。
負責紀念幣"運作"的中國青基會基金部劉文華，在《希望工程調查報告》一書中對此做了陳述：希望工程紀念幣發行2000萬枚，經我們努力，中國人民銀行直接"批給"了我們1000萬枚，讓我們在希望工程實施系統內發行，這是空前的，可能也是絕後的。我們把500萬枚兌換給各省青基會（記者調查發現：並未全部按原價1元兌換給各省），另500萬枚用於裝幀爲紀念品，現在（1997年）一枚紀念幣的市場價格達到30元……劉文華說：如果"控制得再嚴些，收入可這2個億，甚至會更多"。
記者曾向希望工程原財務人員追問：兌換外幣捐款所產生的"溢價收入"，以及"運作紀念幣"的超值收入，合計到底有多少？這些財務人員的回答，模糊而又不盡相同，有人說，"僅外幣溢價兌換一項，就大大幫了老徐一把"；有人說，"1000萬枚紀念幣，按每枚平均獲利5元計算，就有5000萬元的溢價收入，這是最保守估計"；還有人說："結對"救助小學四五年級學生，因爲救助對象不到五年就畢業了，因此捐款有結餘，數額也很巨大；又有人說：發起並組織希望工程義演、義賽，收入也不少……
記者驚問：你們都曾在財務部工作，怎麼會說不清呢？
他們回答：對不起，上述運作並未全部納入青基會的財務管理。
說不清的，暫且擱置。讓我們找一點能夠"說清楚"的來說說。
徐永光曾在2001年對某報記者說："11年來，中國青基會的工作經費總支出是8800萬元"（注：年均800萬）；"利用每年平均大約5600萬的待拔捐款的增值"，11年來，青基會總計獲得了7000多萬元的收入；但相互折抵，到2001年3月"中國青基會已經有1700萬元的赤字"。
不過，幾位青基會的財務人員指出：按保守估計，中國青基會外幣兌換溢價、紀念幣運作、足球義賽、文藝義演等等，其總收入應該超過6000萬元，足以填補1700萬元的工作經費"窟窿"。
還有，記者請柳楊幫助算了一筆賬，如果徐永光能夠遵紀守法"不去投資"，而是把希望工程的"待撥款"全部存在銀行裏，按照1989年至2000年逐年銀行利息，以1年期存款和3年期存款計算，青基會也可分別獲得5205萬元（1年期）或者5804萬元（3年期）的穩定收益。