据香港香港“太阳报”报导，中华鲟研究所科研中心主任刘灯红表示，自二零零三年三峡大坝蓄水以来，长江水温下降，泥沙量逐渐减少，流量改变。在夏季泄洪时，江水中的氧气、氮气等气体含量发生变化，造成鱼类大量死亡，泄洪愈多的年份，对鱼类的影响愈大。
由于“变江为湖”，许多适合急流生长的鱼逐渐向上游迁移，进而改变鱼类种群的结构。报导说，最重要的是，三峡大坝阻断鱼类回流产卵的通道，造成不少逆流而上产卵的鱼类撞坝而亡。
据报导，中华鲟的生存空间已由原来的八百公里江段、十六个不同区域压缩到一个面积狭小的区域，而群体数量也从过去每年三千至五千尾左右，减少到现在的不足三百尾。
中科院武汉水生生物研究所专家表示，三峡刚开始蓄水时，洞庭湖的水位下降一至两公尺，目前水位已下降至五公尺，很多小支流出现干旱、断流，渔业资源愈来愈少。
专家呼吁，除加大资金投入外，还应在长江沿岸再多建鱼类自然保护区，加强珍稀鱼类的繁殖保护工作。