今年是三峡大坝主体工程竣工一周年，大坝上游640公里的长江水域已经成为一个大水库。有地质学家称，三峡大坝拦截水量产生的庞大重力已经开始在好几个地点侵蚀长江陡峭的河岸。再加上水位波动频繁，因而引发了一系列的滑坡灾害。
法国国际广播电台消息说，问题最早于2003年6月出现，在三峡大坝下闸蓄水两周以后，当大坝水位突破90米向135米逼近时，峡谷的边坡在水压的作用下开始被侵蚀。
在距离三峡大坝上游16公里的一个叫庙河的村庄，世代种植柑橘和梯田水稻，庙村的地质结构因为这样的原因而遭到破坏。今年春天，村民们发现有一条长200米宽1厘米的裂缝横贯稻田。而不久之后，大坝开始放水为夏季汛期作准备。
到了5月初，雨季来临使水库水位再次上升，距离庙河村不远处，5天内发生了4次坍塌。当地村民说听到了房屋的木质结构由于地面移动而开裂的声音。政府也要求他们疏散。庙河村的官员担心，一旦整个山坡塌入水中，附近的居民将因此丧命，同时还会威胁到至关重要的长江水道运输。
今年的7月14日，一条长江支流发生特大泥石流灾害，一块长、宽均在1公里左右，而厚度为18米的山体落入江中，13名农民被吞没在泥石流中，而落入江中的石块激起两层楼高的大浪，摧毁了20余艘船舶，并导致11名渔民丧生。虽然官方称这次灾害乃暴雨所致，但地质学家称，是江水水位突然变化导致了河岸岩石松动。
专家们还认为水库水位的波动是今年湖南奇特鼠灾的根源。
除此之外，三峡大坝阻挡了淤泥流向下游，使包括上海地区在内的长江入海口收缩，海洋的咸水正在倒灌入内陆。世界野生动物协会今年春季公布的一份报告称，通过三峡大坝的水流速度目前正在加快，对下游的防洪大堤造成破坏。未经处理的污水和化肥残留物被不断排入大坝水库，导致巨型水藻生长泛滥，并威胁到下游的水供应。
由于中国面临日益严重的缺水问题，长江环境变化带来的问题正使得局势变得更紧迫。据世界野生动物协会的报告称，长江流域的污水排放量激增，2000至2005年间增长了一倍以上。而在这一地区生活着1.6亿人，其中包括位于三峡大坝上游640公里处全球的最大都市──重庆的3,000万人。在1995至2005年间，长江流域的经济年均增长率为12.6%，超过中平均水平，该地区正迅速从农业经济向重工业经济转型。
科学家和政府官员声称，该地区有许多污水处理厂，污水在排入水库前会先经过处理，但实际上一些污水处理厂并未与城市排污系统相连。三峡工程建设委员会水库管理部副主任周伟承认，排入三峡水库的污水正在增加。他表示，政府已投入更多资金确保处理厂能24小时运转。
三峡大坝是否能履行其调节洪水这项主要的功能也受到质疑。今年7月长江上游地区连续数周大雨，形成了自1998年来最大的一次洪水，98年那场大洪水导致长江中、下游地区数千人丧生，当时三峡大坝尚未建成。8月1日政府宣布洪峰安全通过三峡大坝，并将长江中、下游地区的安澜归功于大坝的防洪功能。
伦敦帝国学院的一个调研小组今年早些时候在《工程地质和水文地质学季刊》上发表文章称，边坡失稳是三峡地区最普遍自然灾害的成因所在。该学院的地质学家伊欧尼斯·弗尼阿迪斯在观察过秭归、巫山和巴东县的卫星照片后发现，3%的边坡处于活跃的下滑状态，7%的边坡因为修路等活动而不稳定，另有15%基本稳定。目前中国的新闻媒体已开始对三峡大坝存在的问题进行报导。虽然政府方面一直未对大坝和水库的问题公开表态，却已悄悄地制定了一套塌方事故早期预警机制，并支持对划定高危地区的研究。政府还将投入资金用于建设水处理厂、加固约2,250公里长的江堤。
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