事實上，藉由1917年的十月軍事政變而奪取政權的蘇聯布爾甚維克的核心領導人，如列寧、托洛茨基、斯維爾德洛夫、捷爾任斯基、卡岡諾維奇、季諾維也夫、加米涅夫、拉狄克、明仁斯基、布哈林等都是猶太人。據悉，當時蘇共政治局常委24人中，有16人是猶太人。
1924年，斯大林取得蘇共最高領導權後，直至1939年《蘇德互不侵犯條約》簽署之前，斯大林對於猶太人採取的是任用、拉攏的手段。除了托洛茨基、季諾維也夫和加米涅夫繼續被任用外，斯大林忠實的追隨者卡岡諾維奇、李維諾夫、邁赫利斯、蘇聯駐德國大使雅可夫•蘇里茨等也是猶太人，甚至其祕書室中也有兩個猶太人。
1939年《蘇德互不侵犯條約》簽署前後至1941年6月德國入侵蘇聯，蘇共對猶太人採取了壓制政策，猶太人成爲了斯大林討好希特勒的犧牲品。如蘇聯駐柏林大使猶太人雅可夫•蘇里茨被召回，李維諾夫被撤換，卡岡洛維奇被免除了部長職務，其他猶太高級別官員也悄然被排除。此外，幾十萬猶太人被逮捕，具體死亡人數已無法統計。
納粹德國進攻蘇聯後，斯大林轉而再次任用猶太人。戰時，蘇聯有許多猶太人蔘加了反對納粹的戰爭。在該國未被佔領地區的200多萬猶太人中，大約有50萬人在部隊服役。其中，在戰場上陣亡的猶太人大概將近20萬。
然而，戰爭結束後，猶太人的日子也沒有好過多少。當1947年冷戰在歐洲拉開序幕，以色列宣佈倒向西方陣營後，斯大林開始實施對猶太人的消滅政策。因爲蘇聯國內的猶太人顯然支持以色列，他們不顧政府限制，以各種各樣方式，向以色列人表達他們對以色列國的祝賀；尤其是他們當見到駐蘇公使梅厄夫人和蘇聯軍隊中的猶太人時都圍觀歡呼，甚至熱淚盈眶，倍覺親切。這引起了斯大林的不滿，他懷疑國內外的「猶太復國主義者」會相勾結，將蘇聯國土也劃出一部份建立猶太人的國家。因此，對猶太人的清洗開始了。
這場「反猶運動」的主要事件和總導火線，是審判蘇聯「猶太人反法西斯委員會」的所有成員。該委員會成立於 1942年4月，主要爲蘇聯政府向美國籌措軍費。成員除外交部副部長左洛夫斯基和莫洛托夫的妻子外，大多是著名的蘇聯猶太裔文化名人。委員會爲蘇聯募集了很多錢，有力地支持了蘇聯的反法西斯戰爭。然而，惱羞成怒的斯大林將心中的怒火全部撒在了「猶太人反法西斯委員會」的所有成員身上，指控這個委員會同美國一起準備在克里米亞建立起猶太人前哨陣地。主要成員因此均被處決。
與此同時，數以千計的猶太人被囚禁或死在集中營裏。1950年8月的「斯大林汽車製造廠」案件中，一批醫生、工作人員（大多爲猶太人）被捕並於11月被槍決。「反猶運動」還迅速擴大到各個領域，許多猶太族作家、文學家、演員以 「爲外國服務和企圖使克里米亞的猶太人脫離蘇聯」的叛國罪名於1952年被槍決。同年，蘇聯在布拉格也進行了同樣慘絕人寰的大屠殺，許多猶太人「被吊死在屠戶用的肉鉤上，享受的是希特勒處決人犯的絞刑」。
1953年，「反猶運動」達到了高潮。當年1月發生了「克里姆林宮醫生陰謀案」，長期爲蘇聯領導人治病的有9 個猶太人（實際只有4 人可以確定爲猶太人）被捕。斯大林藉此將成千上萬的猶太專家從醫療機構、研究所、醫院及高等院校中被趕走。此外，斯大林還強迫蘇聯文化界和科技界的猶太裔知名人士在《致〈真理報〉編輯部的信》上簽名。這是一封用惡毒語言誣衊猶太人的信，很多猶太人在巨大的壓力下被迫簽名。
直至1953年3月斯大林去世，迫害猶太人的行動一直沒有停止。有人稱：「甚至在黨的區委書記中，恐怕也很難找到一個猶太人。」有人統計，遇害的猶太人在100萬以上。
